Estudios conformacionales de dímeros peptídicos por métodos teóricos

Resumen

LA PRESENTE TESIS DOCTORAL ABORDA EL ESTUDIO CONFORMACIONAL DE PEPTIDOS DE PEQUEÑO TAMAÑO Y SUS DIMEROS, O CICLOS FORMADOS POR PUENTES DISULFURO, MEDIANTE MODELOS BASADOS EN FUNCIONES EMPIRICAS DE POTENCIAL. CONCRETAMENTE SE HAN UTILIZADO LAS FUNCIONES ECEPP DE SCHERAGA Y CVFF DE HAGLER ET AL. Y LOS PROGRAMAS DE CALCULO ECEPP/2 Y DISCOVER. EL PRIMERO DE ELLOS HA SIDO MODIFICADO PARA PERMITIR EL ESTUDIO DE DOS CADENAS PEPTIDICAS. EN CUANTO A LAS TECNICAS, SE HAN REALIZADO MINIMIZACIONES DE ENERGIA, DINAMICAS MOLECULARES Y CALCULOS DE ENERGIA LIBRE. EL ESTUDIO SE HA CENTRADO EN TRES CASOS PARTICULARES. EN PRIMER LUGAR, SE PRESENTA EL ESTUDIO DE LA DIMERIZACION DEL TRIPEPTIDO LYS-ALA-ALA, QUE HABIA SIDO CARACTERIZADO MEDIANTE DIFRACCION DE RX, ENCONTRANDOSE UN BUEN ACUERDO ENTRE LA ESTRUCTURA EXPERIMENTAL Y LAS DETERMINADAS EN EL TRABAJO. EN SEGUNDO LUGAR SE HA ABORDADO EL ESTUDIO DE DIVERSOS PEPTIDOS MODELOS Y SUS CICLOS FORMADOS POR PUENTES DISULFURO, CENTRANDO LA ATENCION EN EL EFECTO DE LA LONGITUD DE LA CADENA Y LA CICLACION SOBRE LA FLEXIBILIDAD. POR ULTIMO, SE HA ESTUDIADO EL SISTEMA (CYS-PRO-D-VAL-CYS)2, CON EL OBJETIVO DE ANALIZAR SUS POSIBILIDADES COMO SECUESTRANTE ESPECIFICO DE IONES.