Reconeixement molecularcomplexos d'inclusió amb ciclodextrines i complexos d'associació amb agents de solvatació quirales. Estudis per mecánica i dinámica molecular

Resumen

Tesis situada en el campo de las simulaciones teóricas aplicadas al reconocimiento molecular. Se centra principalmente en el estudio de los complejos de inclusión bimodales con ciclodextrinas, y en concreto en los siguientes temas: * Estudio de la preferencia de inclusión de la beta-ciclodextrina para los grupos fenilo, ciclohexilo y alquilo, así como sus derivados naftalenos, antracenos y decalinas, realizado mediante métodos de mecánica molecular. * Estudio de la preferencia de la inclusión de la beta-cilodextrina para los grupos alquilo y arilo, aplicado a los alcanoatos de nitrofenilo, realizado con métodos de mecánica y dinámica molecular. Los resultados han sido comparados posteriormente con los datos experimentales disponibles. * Estudio de la preferencia de inclusión de la beta-ciclodextrina apra los grupos metidlo y trifluorometilo, estudiando la complejación del acetato de fenilo y el trifluoroacetato de fenilo. También se ha estudiado la diferente cinética de hidrólisis de estos dos substratos, así como su catálisis en presencia de la beta-ciclodextrina. Estos estudios se han llevado a cabo con métodos de mecánica y dinámica molecular. * Estudio de la diferencia de energía de complejación del p-terc-butilvenzoato de p-terc-butilo y de la N-p-terc-butilfenil-p-terc-butilbenzamida con un dímero de beta-ciclodextrinas unidas por un puente disulfluro, así como su energía libre de solvatación, mediante simulaciones de perturbación de la energía libre. Por otro lado, también se ha elaborado un método para estudiar la geometría y estabilidad de los complejos de asociación entre agentes de solvatación quirales y diferentes substratos quirales, usado para simular la estructura de complejos de asociación obtenidos en el mismo grupo, relacionando datos experimentales de efecto nOe obtenidos por Resonación Magnética Nuclear con las estructuras obtenidas en los cálculo. La naturaleza y geometrí