Determinación de potenciales analíticos para el estudio de las interacciones en biomoléculas. Aplicación al estudio de distintas propiedades

Resumen

El trabajo consiste en un analisis conformacional teorico de polipepados hidratados. Hemos construido una funcion potencial que tiene en cuenta ademas de las contribuciones energeticas correspondientes a las interacciones electrostaticas, de atomos no enlazados, de enlaces de hidrogeno intramoleculares y de torsion; una energia de hidratacion especifica y otra no especifica segun el modelo que para peptidos hidratados han propuesto scheraga y colaboradores. Posteriormente se calculan las energias conformaciones de las n-acetil n-metil-amidas de los veinte aminoacidos naturales hidratados; variando los angulos rotacionales 0 y etre 0 y 360 con incrementos de 18., para cada angulo lateral que variamos entre 0 y 360 con incrementos de 60. Los resultados se representan en forma de mapas de nergia. Con el conjunto de energias obtenido y haciendo uso del modelo de isomeros rotacionales y de las tecnicas de calculo matricial de flory y colaboradores, se calculan las propiedades conformacionales: dimensiones, momentodipolar (haciendo uso del metodo de orbitales moleculares mindo/3), difusion de luz y constante kerr. En las propiedades opticas utilizamos el modelo de valencia optica para calcular la parte ansotropa del tensor de polarizabilidad. Este calculo de propiedades lo extendemos a los homopolipeptidos de los veinte aminoacidos naturales y para diversas enzimas y proteinas. Generalizamos el modelo a otros disolventes como el metanol. Los resultados se comparan con los valores teoricos y experimentales encontrados en la bibliografia, siendo en conjunto bastante satisfactorios.